提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

【地评线】金羊网评：以“滚烫初心”奔赴赶考之路******

　　新时代新征程，党员干部要把为民造福作为最重要的政绩，怀揣为民初心，根植为民之情，一路乘风破浪、砥砺前行，以“滚烫初心”奔赴赶考之路，为民生事业的发展和进步贡献智慧和力量。

　　秉持真挚初心，以“时时放不下”之心笃守信念。为民造福是我们的岗位职责所在，也是我们的人生价值所在。从防风治沙的谷文昌到种植绿林的塞罕坝建设者，再到在绝壁上开凿天渠的黄大发，他们心中装着人民，以艰苦奋斗的精神赢得人民的信赖和点赞，为我们留下了永恒且闪耀的精神丰碑，留下了毕生学习、一生追寻的宝贵精神财富。作为党员干部，我们要秉持真挚初心为民服务，始终把人民群众放在心中最高位置，心系群众冷暖，情牵百姓所念，行向百姓期盼，以“时时放不下”的至诚之心托举群众更加幸福的日子，朝着人民期盼奋力奔跑，和人民群众感同身受、并肩而行。

　　激发热血豪情，以“事事都上心”之劲拼搏奋进。在为民服务的实践中，党员干部要敢于吃苦做到“不挑活”，要做到知重负重“扛重担”，以不推脱、不懈怠的“满格状态”为民奋斗，以充满温度的关怀、有实效的举措回应群众呼声，做到“事事都上下”“事事抓在手”。前进之路上，必然会面对各种考验，党员干部要有攻坚克难的斗争之志，要有奋斗为民的热血豪情，找准问题的“关键点”，克服工作实践中面临的各种考验和困难，以问题的解决解民生之忧、谋民生之利，推动民生事业更上新台阶。

　　发扬实干精神，以“点滴在心头”之情真抓实干。“路虽远，行则将至；事虽难，做则必成。”站在历史新起点上，党要有不怕险阻、事必干成的决心和毅力，在为民实践中发扬滴水穿石、久久为功的实干精神，以“功成不必在我”的精神境界和“功成必定有我”的历史担当扛起岗位责任，以深切之情、务实之举真抓实干，以“辛苦指数”换取群众的“幸福指数”。征途漫漫，惟有奋斗。要拿稳接续奋斗的“接力棒”，坚持一茬接着一茬干、一仗接着一仗打，满怀自信走好奋斗之路，昂扬奋发奔赴美好未来，把人民群众的向往逐一实现，助推民生事业取得新的进步，做到事事有回应、件件有着落。（李俊成）